Fue la primera fundación de un convento en Huelva en 1510. El título que se le dio es el de Santa María de Gracia compuesto por Agustinas Calzadas, provenientes en su origen del convento de San Leandro de Sevilla y promovido por Doña Elvira de Guzmán y Maldonado, condesa de Niebla.
La primitiva construcción del convento es gótico mudéjar y como material constructivo el ladrillo, la madera y el yeso, siendo escaso los restos de sus primitivas trazas por haber sufrido remodelaciones posteriores, sobre todo de época barroca.