Le musée a ouvert ses portes en 1973, offrant à la ville un espace culturel présentant tout, des découvertes archéologiques de la période préhistorique de Huelva aux dernières expressions artistiques du XXe siècle, avec des œuvres remarquables de Daniel Vázquez Díaz et José Caballero.
Il comprend deux sections : une collection archéologique remarquable, mettant en valeur les découvertes tartessiennes, et une collection de Beaux-Arts provenant des collections du Musée des Beaux-Arts de Séville.