O museu foi inaugurado em 1973, oferecendo à cidade um espaço cultural que exibe desde achados arqueológicos do período pré-histórico de Huelva até as últimas expressões artísticas do século XX, com obras notáveis de Daniel Vázquez Díaz e José Caballero.
Ele contém duas seções: uma notável coleção arqueológica, destacando achados tartessianos, e uma coleção de Belas Artes das coleções do Museu de Belas Artes de Sevilha.