Aus den Chroniken geht hervor, dass Cristóbal Dorantes im Mai 1505 seine Häuser für den Bau der zweiten Pfarrei der Stadt zur Verfügung stellte, die Unserer Lieben Frau von der Empfängnis geweiht war. Mit dem Bau wurde im Jahr 1515 begonnen.
Die ursprüngliche Kirche bestand wie heute aus drei geräumigen Schiffen mit einem Hauptaltar, von dem keine Spuren mehr vorhanden sind. Es handelt sich um ein gotisch-mudéjaresisches Bauwerk mit barocken Elementen, das nach dem Erdbeben von Lissabon im Jahr 1755 hinzugefügt wurde, bei dem es schwer beschädigt wurde. Es wurde 2006 vollständig restauriert.
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